而人造魂灵也遇到的瓶颈，需要大量的真正魂兽来配合实验才行。对于这个问题，星斗大森林一方的魂兽，一开始是配合的。但随着，研究的持续，死亡的魂兽也越来越多，当时的黑市之上还出现了倒卖**魂兽的地下交易，一时间魂兽的数量大减。
一开始，它们以为，人造魂灵研究出来后，这样的情况就会好转，这是必要的牺牲。但是，它们低估了人类的贪婪**，后来，人造魂灵研究出来了，他们的**也更加的不可控了。他们总能找到各种理由，如人造魂灵缺陷太多，不完善等等。
对魂兽进行大量捕杀，而随着魂导科技的提升，魂兽的反抗也越是无力。传灵塔发展到最巅峰的时候，强迫魂兽签订不平等条约，圈养过星斗大森林的凶兽的。
直到一万多年前，魂兽共主，银龙王古月娜。混入了人类社会，改善了魂灵的缺陷，并助人类，研究出了万年级别的魂灵。又在这融合魂灵的契约中，下了精神烙印，然后，和龙皇斗罗唐舞麟“同归于尽”后，才迫使人类，不得不妥协。
人类也只能按照吩咐，帮助魂兽重新建设家园，同时随着母星吞噬深渊位面的进化，人类也向太空发起进击。